Hvor Lyø Mølle ligger, har der i over 50 år - fra 1821 til 1876 stået en stubmølle. Den har en omskiftelig historie. Oprindelig hørte den hjemme i Fåborg. År 1793 blev den flyttet til Ærø, og 1821 til Lyø, hvor den i 1876 blev nedreven for at afløses af den nuværende vejrmølle.

Tegning efter gl. fotografi af stubmøllen på Lyø

Fyn er den af vore større landsdele som er fattigst med hensyn til stubmøller. Ikke en eneste er bevaret. Derimod findes der endnu nogle stykker i andre landsdele. Bornholm, Falster, Lolland, Sjælland, Samsø og Sønderjylland